*概述：蒙古汗国虽然建立了，但是外部与内部的敌对势力却使这个新生的政权危机四伏...
蒙古国建立后，一些成吉思汗的敌对势力并未被全部消灭，他们还在梦想去推翻成吉思汗的统治，尤其是乃蛮部余篾儿乞部的一些残党余众，仍然是成吉思汗的一块心病。太阳汗死后，他的弟弟和儿子都出逃在外。于是成吉思汗派哲别去追击这些残余势力，在兀鲁塔山一带杀死了太阳汗的弟弟杯禄汗，太阳汗之子屈出律与篾儿乞部的脱脱向西逃亡，脱脱在额尔齐斯河被蒙古军追杀身亡，屈出律逃往西辽，自此，乃蛮部全部并入蒙古汗国。
在蒙古汗国内部也并不是相安无事。
成吉思汗曾任命豁儿赤为万户长，并允许他纳妾三十名。由于秃马惕部的美女较多，因此豁儿赤便强行向秃马惕部索要三十名美女，这种行为引起了秃马惕部人的不满，于1215年秃马惕部囚禁了豁儿赤。成吉思汗听说此事后，派斡亦剌部忽都合别乞去招降秃马惕人，
没想到使者也被囚禁，这使得成吉思汗勃然大怒，便派孛罗兀勒带兵去征讨斡亦剌部，但是孛罗兀勒的军队在途中中了秃马惕人的埋伏，兵败撤回。成吉思汗只得又派朵儿佰朵黑申率兵平息了秃马惕部的这场叛乱。
此外，蒙古国内部的萨满教一些势力也比较猖獗，身为萨满教巫师的阔阔出，以其特殊的地位和身份，在成吉思汗面前挑拨与其兄合撒儿的关系，他曾对成吉思汗说合撒儿也是上天将要降大任之人，如果不及早采取措施，迟早合撒儿会自立为王。成吉思汗轻信了阔阔出的话，将合撒儿逮捕。这件事情被成吉思汗的母亲诃额仑知道后，非常生气，亲自到成吉思汗处劝说，告诉成吉思汗无论如何也不应该残害自己的兄弟，成吉思汗是一个孝子，在母亲的压力下，不得不释放了合撒儿，但是却暗地里没收了合撒儿的属民和财产，只留下一百余户。这件事情才得以平息。
后来，阔阔出聚集了很多士众，这些士众中包括成吉思汗弟弟帖木格斡惕赤斤的属民。斡惕赤斤听说后很生气，前往阔阔出处索要他的属民，没想到却遭到了阔阔出等人的嘻笑威胁，更为出格的是阔阔出让斡惕赤斤跪在他身后以示悔悟。这次事件后，阔阔出聚众与汗抗衡的野心暴露无遗。于是一次成吉思汗借摔跤为名，处死了阔阔出，打击了萨满教的嚣张势力，
在清除残余敌对势力、平息兀马惕部叛乱、镇压阔阔出政变的斗争中，成吉思汗再次以自己高超的智慧维护和巩固了他的最高汗权。