*引子：林丹汗对科尔沁、喀尔喀以及察哈尔本部内的讨伐不过是想惩除叛逆，维护蒙古的统一和稳定，但是意料不到的却是这种残酷的征讨行为，反而加速了蒙古左翼各部投靠后金的步伐。
科尔沁背叛蒙古，不仅削弱了蒙古的军事实力，也使得身为整个蒙古大汗的林丹颜面无光，他不能容忍背叛及这个事件带来的负面影响，于是决定讨伐科尔沁部。
1623年11月，林丹汗率军前往科尔沁奥巴洪台吉所在地格勒殊尔根城，围城问罪，林丹汗的大举讨伐，使科尔沁感到前所未有的恐慌，急忙派出使者前往后金求援。科尔沁奥巴洪台吉抱定了拼死固守的决心，使林丹汗的攻城计划受到了极大的阻挠，因此久攻不克。后金方面，努尔哈赤虽然率军赶去援救，但他并没有真正的想要与蒙古正面交战，努尔哈赤不过是不得不派出援救的样子而已，因此大军到达北堡后改派莽古尔泰率精兵五千前往援助。但是林丹汗由于久攻不克，又恐怕后金援兵到来后腹背受敌，于是撤围而去，科尔沁的局势于是很侥幸的转危为安。
征讨科尔沁失败后，林丹汗与后金都开始武力征讨举棋不定的喀尔喀。1626年，后金攻打喀尔喀炒花所在地乌齐叶特部与巴林部，后金获全胜。逃脱后的炒花只好率众投奔林丹汗，林丹汗趁机吞并他的余部。1627年，林丹汗又率众兼并了巴林，札鲁特残部。从此喀尔喀五部在后金与林丹汗的交潜打击下灭亡。
其实在察哈尔本部中也不是太平无事的，敖汉与奈曼部在此时与后金也发生了联系，就在敖汉与奈曼部处于徘徊之际，林丹汗亲率大军进行讨伐，残酷的兼并行为反而将敖汉与奈曼两部推向了后金，1627年6月，敖汉部、奈曼部率众归附后金。9月，西部的都令，乃蛮黄把都、包俾等万余人投降后金。从此，作为蒙古的正统象征的所在地察哈尔本部也开始四分五裂。
虽然林丹怀有一颗统一蒙古、振兴蒙古的雄心，他对科尔沁、喀尔喀以及察哈尔本部内的讨伐不过是想惩除叛逆，维护蒙古的统一和稳定，但是意料不到的却是这种残酷的征讨行为，反而加速了蒙古左翼各部投靠后金的步伐。