元代蒙古族崇拜柳树、榆树、白桦树等，并由此产生向树祈祷的习俗。蒙古的萨满教崇拜绿荫蓊郁、独立支撑、鲜花盛开、耸入云霄的参天树，这种观念是与崇拜长生天的观念联系在一起的。他们认为参天树上住着他们的守护神宝木勒。
动物崇拜更是蒙古族生物崇拜的主要内容，尤其是对以狩猎为主要生产劳动方式的蒙古族先民来说，动物是他们赖以生存的资源，自然格外受尊崇。这在许多阴山岩画里都有鲜明的表现，而且动物的形体在岩画中被刻意地夸大了，人在岩画中的形象反而很矮小，并且在对动物进行顶礼膜拜时候的动作都是极尽谦恭可掬之态。
“神”在蒙语中称为“昂道”，如“巴日昂道”（虎神）、“少布昂道”（鸟神）、“朱贵昂道”（蜜蜂神）等。蒙古族萨满教崇拜的动物种类很多：其中熊被看作是神明和布里亚特蒙古族的祖先；骏马被认为是人死后通往天堂之路的坐骑神兽；蛇也被描绘成守护神宝木勒手中的长鞭而受到崇拜；狗的形象在阴山岩画中很多见，形态各异，关于狗的禁忌和对狗的保护尊崇表现出了蒙古民族对狗这种动物的特殊感情；一种被称为“海青”或“海东青”的鹰因其勇悍顽强而受到蒙古族的崇拜，白色的海青更被看作氏族的神灵，在元代的蒙古帝国时期，白海青是战神的象征。